第一卷《缘起海花》，主要讲述了主角海宝儿从出生被带离武王朝至其十五岁这段时间的故事，故事篇幅占比不多，总结来说，可以归纳为四个部分。
【第一部分】0-5 岁阶段，为海宝儿的幼童时期。
这个阶段，海宝儿家族覆灭，历经波折来到海花岛，在这里过上了无忧无虑的生活。
幼童的他，喝百兽奶，得百兽缘，并且对身边的一切都充满好奇，每日除了陪伴几位养父母外，就是熟悉海花岛上的犄犄角角、边边落落。幼童海宝儿虽困于海岛，但花草树木，虫鱼鸟兽，都成为了他最为在意的东西。所以于他而言，一花一草皆风景，一虫一兽亦有情。
【第二部分】5-15 岁阶段，为海宝儿学习启蒙时期。
从 5 岁生日那一天开始，海宝儿就顺理成章地接受了九位养父母非常严苛的技能训练——跟随八爸关文贡学文练字，见乾坤，悟日月；跟随九爸第五知本学医治病，行仁心，谱大爱；跟随六爸崔旻格物致知，铸匠心，秉臻心；跟随二爸、四爸习武练体，砺心智，修身德……总之，跟随不同的人学习不同的本领，是海宝儿技能提升和三观养成的最佳方式。
与此同时，在日常生活中，海宝儿还逐渐知晓了每个养父母很多不为人知的过往——二爸符元，江湖人称“赤面狐”，年轻时曾与武朝公主有过一段刻骨铭心的爱情故事；四爸伍三曾，为兄弟之情怒杀纨绔，得罪权贵，被迫远走海外避难；九爸第五知本，承先祖遗志，儒医至德，济世无我。
【第三部分】15 岁的那年，为海宝儿憧憬未来时期。
向往岛外生活，是少年海宝儿一直坚持不懈的想法和愿望，为了能够顺利出岛，他试图说服父母，同意外出游历，为了圆梦，他接受了养父母们对他的各项考核。
最后，不管是文考武试、医术考核，还是经义策论、排兵布阵，海宝儿都能从容应对，轻松过关，从而用实际行动证明了自己的实力。
【第四部分】开启东莱之旅。
正当各项考核接近尾声之时，两件事情的突然发生打破了原本平静的生活，也打乱了既定的考核计划：第一件事是，与海宝儿一起长大的花豹“二喵”，突然在孤山深处离奇死亡，凶手不明；第二件事是，芭栀的一封家信带来了东莱岛内乱的消息。众人猜测，看似毫无关联的两件事情，其背后可能隐藏着同一个巨大的阴谋。
为了终结东莱内乱，帮助顺义蕃族顺利脱险，拯救东莱十万岛民于水火，同时为了尽快查出花豹的死因，找出真正的幕后指使，为“二喵”报仇，海宝儿如愿以偿地离开生活了十五年的海花岛，登上了去往东莱岛的海船。
踏入东莱后，海宝儿在户堂辛哥的辅佐下，在骑楼老街开设了东莱岛最大的医馆药铺——知本悬济堂，以行医卖药、行商贸易之名，行帮助顺义、调查内乱之实。